中心设立了动物形态学实验室、动物机能学实验室、微生物与免疫学实验室、食品安全与兽药残留分析实验室、动物传染病学实验室、中兽医学实验室、兽医内科学实验室、兽医外科与产科学实验室和兽医临床诊断学实验室等9个功能实验室和实验动物中心、动物疫病远程诊断室等2个辅助实验室。
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